- Институт травматологиив состав входят ожоговое отделение для взрослых, детское ожоговое отделение, отделения травматологии и ортопедии, нейрохирургическое, гнойное отделение травматологии и ортопедии, отделение медицинской реабилитации пациентов с нарушением функции центральной нервной системы, функциональной диагностики, рентгенологии, консультативно-диагностическое отделение №1, приёмно-консультативное, гравитационной хирургии и гемодиализа, патологической анатомии с консервацией тканей, лаборатория аддитивных технологий, лабораторный сектор, отделение экспериментальной медицины с виварием, лаборатория медицинской биофизики
- Институт педиатрииорганизован на базе бывшего НИИ детской гастроэнтерологии. В состав входят педиатрическое отделение №1, педиатрическое отделение №2, консультативно-диагностическое отделение №2, палата анестезиологии-реанимации, а также неврологическое отделение, занимающееся восстановительным лечением детей с ДЦП, ранней помощью детям с перинатальной патологией, задержкой психо-моторного развития, центр ментального здоровья, центр диагностики и лечения опухолей кожи, детская стоматология
- Институт реабилитацииотделение медицинской реабилитации для пациентов с заболеваниями опорно-двигательного аппарата и периферической нервной системы
- Институт стоматологиитерапевтическое отделение, ортопедическое отделение, хирургическое отделение, рентгенологический кабинет